Взял вот такую карту
Её свойства в FAT32:
Для эксперимента отформатировал в NTFS:
Далее всё нормально записалось в WinHex. После записи свойства карты:
Думаю, что можно сделать вывод - не важно как отформатирована карта (WinHex её отформатирует сам), главное чтобы её общая ёмкость (свободно+занято) была больше 15 718 400 000 байт