Была такая же проблема в процессе эксплуатации Тойота 4runner 2002 г.в. двигатель 3,4 л. V6 с ГБО. Мастер на газовом сервисе посоветовал погонять недельку другую чисто на бензине, задвинув что то про разницу температур горения рабочей смеси бензина и газа, "...тепловые зазоры..." и о гов%ном качестве газа (да уж конденсата там немерено). И, о чудо, спустя дней 10-12 постепенно - не сразу, проблема ушла
Правда машину продал спустя месяц. Но новый хозяин ни разу про подобный косяк не упоминал.