По определению - при зарядке АКБ на автомобиле лучше снять минусовую клеммлу как минимум.
Только непонятно - почему сложно при этом снять плюсовую клемму
Собьются настройки радиостанций магнитолы, если в ней нет энегронезависимой памяти. В штатной нет.
Могут сбиться настройки работы АКПП, внесенные под "стиль" вождения. Но этого, скорее всего, вы и не заметите.
Сигналка не собьется, т.к. во всех них предусмотрена функция сохранения предидущего состояния.