[AlexH]

Просто надо побольше внятных варнингов и отсылать на ручное наклякивание, типа если первоначально сохраненный кастомайзинг перестал шится из-за противоречий.
Ну и возможность откатится к первоначальному кастомайзингу-кодингу. Можно каждую сессию бэкапить в виде бин файла. Ну ты сам тут все лучше сообразишь.

Типа надо сразу дать понять пользователю , что основной режим - кастомайзинг, а кодинг - типа для продвинутых, кто внятно понимает, что делает, и требует смены-корректировки кастомайзинга.