Возможно с электроникой проблема, например с одним из датчиков вариатора типа "Датчик скорости вращения на входе (ISS)" или Датчик скорости вращения на выходе (OSS). Учитывая то, что при прогреве поведение вариатора изменяется, очень вероятны сбои в электронной части.
Посмотрите статейку для понимания какие датчики есть
http://www.jeepliberty.biz/t1563-topic