Возможно с электроникой проблема, например с одним из датчиков вариатора типа "Датчик скорости вращения на входе (ISS)" или Датчик скорости вращения на выходе (OSS). Учитывая то, что при прогреве поведение вариатора изменяется, очень вероятны сбои в электронной части.
Посмотрите статейку для понимания какие датчики есть http://www.jeepliberty.biz/t1563-topic
если предположить ,что Вы говорите верно, тогда диагностическое оборудование показало бы расхождение в скорости вращения ведущего и ведомого валов. но никаких проблем диагностика не выявила. или я не так понимаю?