Запускать только с iso-образа, подключенного как полноценный диск. По другому не станет. Разархивировать не нужно.
А на счет подключения, насколько я понял это к разным программам относится. Диагбокс лучше запускать при подключенном сканере.
Кстати, перечитайте форум на раздаче на рутрекере. Там много интересного. Я когда ставил - тоже проблемы были, мучился, сюда писал. Оказалось там на форуме мою проблему уже обсуждали и решили.