А с родного ключа если ставить на охрану нажимая кнопку LOCK - всегда корректно встает на охрану и срабатывает? Если да - претензии к шерхану и его работе с CAN-шиной.
P.S. В вашей машине смысла нет в штатной сигнализации, так как уязвимый к кодграбберам шерхан при снятии себя с охраны - снимает и штатную сигнализацию командой по шине. Другое дело что в вашем регионе вряд ли промышляют воришки с кодграбберами...