Попробуйте в сигналке заново прописать обороты холостого хода
Похоже, что у Вас контроль запуска двигателя реализован по оборотам и ему нужны корректные данные для своевременной отсечки стартера.
Хотя я считал, что обороты ХХ пишутся во флеш-память
А почему аккумулятор помер выяснили?
Так, что по поводу ХХ. Если можно по подробней пожалуйста. И кто это должен делать ОД или установщики сигналки?