[Smileyfox]

Господа, о чем спор то?
Штатный режим зарядки от генератора - обе батареи.
Какие проблемы при зарядке от внешнего источника тех же батарей? Никаких.
Нормальный зарядник отключит зарядный ток при достижении напряжения на батарее, соответствующем полной зарядке - угрозы для бортовой электроники нет.
Раздельная зарядка? Тоже можно, но желательно перед установкой выравнять напряжение батарей, т.к. переходные токи будут при наличии разности потенциалов. Закон Ома все помнят? Сопротивление провода между батареями невелико. Поэтому всеж лучше парой заряжать