На днях, случайно, наткнулся на карвидеорег, который тоже "поганит" под себя (и по своему) SD-карточку: 32Gb карточка, вставленная в обычный считыватель, из под Win7 видна лишь, как 119Мб. Что обидно, карточкой в полном объёме теперь нельзя пользоваться: Paragon Partition Manager™ 11 PE - говорит, что не может отформатировать раздел.
Попробуй raspbmc, нужно сначала установить его на карточку, а потом удалить. При первом шаге он разобъет ее на 2 раздела - FAT и EXT2, на втором - удалит их и вернет один раздел FAT.